На Нью-Йорк обрушилась настоящая угроза в виде могущественного Шредера. Он попытается взять город за считаные минуту, но вы должны ему помешать вместе с мутантами черепашками ниндзя. Эти бравые ребята готовы на любые сложности, чтобы спасти родной город от безумства. У каждого из героев будет своя миссия и цель, кто-то должен приготовить зелье, чтобы уничтожить мутанта, кто-то сбить ракетные установки, а кто-то победить врага в рукопашном бою. На всех черепашек будет только три попытки, если вы проиграете, то город падет.