У стародавній Японії існували два сильних військових ордена. Це були самураї і їх одвічні супротивники ніндзя. Між ними завжди йшла війна і ми з вами в грі Samurai Fighter приєднаємося до цього протистояння на боці самураїв. Вам належить пройти по безлічі локацій і буде битися з солдатами ворога. Вони будуть атакувати вас намагаючись вбити. Ви завдаючи серії ударів руками і ногами повинні будете давати їм відсіч. При цьому уважно дивіться по сторонам. Вам можуть попастися предмети, які ви зможете використовувати у вигляді зброї в своїх поєдинках.
