Допитливий хлопчина на ім'я Ксавьє зі своєю сестрою Ядіна і другом Бредом випадково знайшли під будівлею звичайного музею зовсім інший Таємний музей. Там теж є полиці з експонатами, але вони незвичайні, а чарівні. Це секретне приміщення здатне переносити всіх, хто в ньому знаходиться в часі, де можна дізнатися багато цікавого. У грі Hidden Heroes ви разом з персонажами познайомитеся з різними відомими людьми, які жили в минулому і навіть позаминулому столітті. Музиканти, письменники, поети, вчені попросять дітей відшукати для них інструменти, листки з книжок та інші предмети.