У підземеллі Грибного королівства стали відбуватися дивні переміщення, виявляється, Боузер вирішив напасти на королівство, провівши свої війська з підземним катакомбах. Маріо розкрив підступний план лиходія і спустився, щоб перешкодити. За землею герой втратив свою здатність знищувати ворогів стрибками, тому не слід наближатися до злісним грибам, досить зібрати зірки - це зробить коридори темними і противнику доведеться забратися геть.
