У старовинному замку під прикриттям стародавнього архітектурної будови розташувалася секретна лабораторія. Вона перебувала в підземних катакомбах, якими обладналися замки за часів середньовіччя. Кожен власник замку при його будівництві обов'язково продумував шляху таємного відступу і підземні ходи служили саме для цього. Але повернемося до лабораторії, там якраз стався вибух після одного з експериментів і на волю вирвалися піддослідні істоти, а це страшні мутанти. Вони створені під впливом генних експериментів і являють собою жахливих створінь агресивних і нещадних. З ними вам і доведеться зіткнутися в Secret Base In Old Castle 3.