Ніндзя вирішив розім'яти ноги і пробігтися містом, збираючи монетки. У грі Ninja Runner ви зустрінете героя та допоможете йому влаштувати міський паркур. Для героя немає непереборних висот, ви можете кілька разів натиснути на хлопця і він застрибне на будь-яку вершину: платформу, башту та іншу вершину. Пробігши рівень, можна переходити на інший, але будьте уважні, на нових рівнях з'являться додаткові перешкоди у вигляді гострих шипів, на які не потрібно стрибати, щоб не втратити життєві серця. Гострих перешкод стає все більше, а значить вам доведеться бути дуже швидкими та спритними, щоб уберегти ніндзя від втрати життя в Ninja Runner.
