Відважний ніндзя на ім'я Кіото має піднятися на дах високої будівлі. Ви у грі Ninja Up допоможете персонажу у цій пригоді. Перед вами на екрані буде видно ваш ніндзя, що стоїть на землі. За сигналом ваш персонаж почне стрибати на певну висоту. Ви за допомогою мишки повинні малювати під ніндзя лінію. Як тільки ви намалюєте її, з'явиться спеціальна гумова мотузка. Ваш герой, впавши на неї, зробить стрибок і полетить вгору. Так малюючи дані мотузки у грі Ninja Up ви поступово і допоможете герою піднятися на дах будівлі. При цьому по дорозі ви повинні допомагати ніндзя збирати предмети, які висітимуть у повітрі в різних місцях ігрового поля. За їхній підбір вам у грі Ninja Up будуть давати очки.
