Представьте себе что обычный канцелярский карандаш ожил и теперь старается познать окружающий его мир. Наш персонаж решил отправиться в путешествие по квартире и вы в игре Pen Run поможете ему в этом. Ваш герой должен будет двигаться по пунктирной линии, которая будет видна перед вами. Маршрут будет иметь множество изгибов и поворотов. Вы с помощью клавиш управления должны будете вести карандаш строго по нему. При этом на вашем пути будут попадаться различные препятствия вы должны будете обходить их стороной. Помните что любое столкновение приведет к проигрышу и гибели вашего героя.