Біля невеликого села розташованого в Японії з'явилися живі мерці. Вони блукають ночами навколо поселення і полюють людей. Відважний воїн ніндзя Кіото отримав наказ імператора знищити зомбі. Ви в грі Ninja Versus Zombie допомагатимете ніндзя в цьому. Перед вами на екрані з'явиться місцевість в якій буде ваш персонаж. За допомогою клавіш керування ви будете керувати діями ніндзя. Він повинен буде бігти місцевістю вперед і уважно дивитися на всі боки. Дорогою він зможе збирати золоті монетки та інші предмети, розкидані всюди в локації. Як тільки зустрінете зомбі атакуйте його. Використовуючи різну зброю з арсеналу ніндзя ви будете у грі Ninja Versus Zombie знищувати зомбі та отримувати за це окуляри.
