Юний хлопчик у костюмі ніндзя прибув у невелике старовинне містечко, щоб знайти там вчителя, яке б узяло його на навчання самурайській справі. Він не знав, де живе майстер і почав розпитувати всіх, кого зустріне у Young Samurai Escape, але люди не поспішали відповідати і поглядали на хлопчика з побоюванням. А невдовзі його наздогнав місцевий служитель і запропонував піти з ним. Хлопець думав, що його проведуть до будинку вчителя з бойових мистецтв, але натомість його доставили в каталажку і замкнули на замок. Хлопчик нічого не міг зрозуміти, за що його схопили і чим він порушив місцеві порядки. Він не знав, що Майстер, якого він шукає, у бігах і підозрюється у скоєнні злочину. Містяни думають, що хлопець його спільник. Ви повинні врятувати бідолаху в Young Samurai Escape.