В игре Captain Molly вы познакомитесь с капитаном Молли, который проник на лисью базу, чтобы освободить заложников — маленьких чёрных котят. Их выкрали, чтобы перевербовать и превратить в отряд чёрных убийц. Генерал Эрвин поставит задачу перед нашим героем и вам следует о ней знать, чтобы действовать в соответствии с заданной миссией. Не игнорируйте текстовые сообщения командира, он ничего не говорит просто так, информация будет для вас полезна. Далее вы отправитесь вместе в Молли обследовать лабиринт и будьте осторожны, переходя в очередную комнату, там персонажа встретит вражеский отряд. Отыщите пленников и доставьте их невредимыми. Если хоть одного противнику удастся уничтожить, миссия буде загублена. Одно радует, вы сможете начать заново и попробовать всё же выполнить задание. У самого героя шесть жизней, но их можно расстанавливать, если найдёте чемоданчики с красным крестом.
