Зазвичай люди живуть і не знають, що у них твориться прямо під боком. Так городяни в історії City Hunter Of Monster 3 не підозрювали, що під їхніми будинками в підземних лабіринтах розташувалася секретна лабораторії, де проводилися експерименти на тваринами. Одного разу в системі безпеки стався збій і купа монстрів втекла. Людей вирішили не лякати те, що сталося, а швиденько зібрали групу добровольців, яких нарекли мисливцями на монстрів. Це люди, які добре володіють будь-якими видами зброї і вміють постояти за себе в будь-якій обстановці. Ви - один з них, мисливець одинак. Відправляйтеся на пошуки чудовиськ, щоб вони не встигли наробити непоправної зла.