Кілька років тому земля піддалася зовнішньому вторгненню і людям довелося піти в підпілля. Інопланетяни не тільки заселили наші території, але і почали проводити експерименти з людьми, які опинилися в полоні. Людство не залишало надії звільнитися від гніту прибульців, але тепер у них з'явилася нова загроза - мутанти. Вони з'явилися в результаті схрещування людини і рептилоїди. Ці істот виявилися дивно пристосованими до життя і дуже витривалими. Їх дуже важко вбити і неможливо домовитися. У Strong Kills 3 ви зустрінетеся з ними і спробуєте знищити.