На одній із планет почалася війна між землянами та расою прибульців. Хлопець на ім'я Бен 10 подався на допомогу землянами. Ви в грі Ben 10 Stinkfly Space War допомагатиме йому в битвах. За допомогою Омнітрікса Бен набуде форми інопланетного робота і атакують супротивника. Перед вами на екрані буде видно ваш персонаж, що летить повітрям у бік супротивника. За допомогою клавіш управління ви зможете керувати його польотом і змушувати героя здійснювати маневри у повітрі та набирати чи скидати висоту. Йому назустріч летітимуть ракети, кораблі та інші предмети. Ви повинні будете влучно стріляючи зі своєї зброї збивати всі ці об'єкти. За кожен збитий предмет ви отримуватимете окуляри.