Навіть найсильніший воїн одного разу зустрічається з ще сильнішим і тоді йому доводиться рятуватися втечею і це не боягузтво, а тимчасове відступ, щоб зібратися з силами та взяти реванш. У грі Run Ninja Run ви допоможете герою, який у поєдинку з дуже сильним суперником зазнав поразки. Переможець зв'язав бранця і сів відпочити та подумати, що робити з ним далі. А поки він думав, наш герой примудрився втекти. Тепер все залежить від його спритності і вашої спритності. Сил у героя достатньо, щоб швидко бігти, а ви змушуватимете його стрибати, протискатися у вузькі місця і знищувати пригороди ударом ніг у Run Ninja Run.
