Юний і самовпевнений ніндзя вирушив у подорож, щоб набратися життєвого досвіду, виконуючи пораду мудрого вчителя. Він уже пройшов чимало миль, багато чого побачив і нерідко потрапляв у різні ситуації, в які доводилося використовувати його вміння та навички, які він набув, навчаючись у монастирі. Але у Cute Shinobi Escape він опинився у ситуації, з якої не зможе вибратися сам, йому знадобиться ваша допомога. Герой просто заблукав і не в лісі, а в старовинній споруді. Ваше завдання в Cute Shinobi Escape - знайти героя і вивести його за межі стародавніх будівель, а потім і з лісу.
