Існує цілий культ, де маленькі хлопчики вивчають мистецтво ніндзя. Це дуже складний шлях, який вимагає не тільки хорошої фізичної підготовки, але і сили духу. Дотримуватися всіх законів кодексу ніндзя, може не кожен. У грі Ninja Boy, ви познайомитеся з Куном, хлопчиком, який вирішив присвятити своє життя кодексу ніндзя. Вчора, на його школу було скоєно напад. Нападники, це не люди, а якісь, дуже дивні монстри. Вони викрали всі скарби школи ніндзя. Тепер, тільки Кун може повернути вкрадене, але, йому потрібна ваша допомога. Ви повинні направляти його так, щоб він, за мінімальну кількість ходів, вбив монстрів і повернув скарби.