У сучасній Японії до цих пір таємно існує таємничий орден воїнів ніндзя. Деякі з цих воїнів навіть беруть замовлення на вбивство злочинців які займають високі пости в уряді. Сьогодні в грі Gun Ninja ми з вами будемо грати за такого найманця. Він прийняв замовлення на вбивство і тепер йому потрібно проникнути в охороняється маєток. Спритно проходячи по його коридорах, перестрибуючи провали в підлогах і уникаючи пасток ми будемо просуватися вперед. На нас звичайно ж будуть нападати солдати охорони, але ми за допомогою вогнепальної зброї будемо вбивати їх усіх. Головне не дати їм підібратися до вас близько, адже тоді вони зможуть завдати вам шкоди своїм мечами і вашого героя вб'ють. Але ви можете по дорозі збирати аптечки, що б заповнити свій рівень життя.
