Маленький мишеня Том дуже любить сир. Як то раз він проник в будинок одного торговця сиром що б вкрасти його якомога більше. Але ось біда що б дістатися до сиру мишеняти потрібно буде вирішити безліч головоломок. Ви в грі Cheese and Mouse повинні будете допомагати йому в цьому. Де то на ігровому полі буде розташований сир. В іншому місці буде знаходиться наш персонаж стоїть на якихось предметах. Ви можете прибирати деякі з них. Тепер ви повинні розрахувати які саме предмети потрібно прибрати що б ваш герой зміг опинитися на сирі. За це вам дадуть окуляри і ви продовжите проходження рівнів.