У новій грі Ninja vs Ninja ви підете в світ, де живуть люди коробки. Тут йде війна між двома орденами ніндзя і ви приєднаєтеся до одного з них. Ваш персонаж це людина коробка червоного кольору. Він опиниться в приміщенні де знаходиться його супротивник синього кольору. Між ними будуть розташовані різні перешкоди і пастки. Ви повинні будете провести свого персонажа через всі ці небезпеки і атакувати свого противника. Використовуючи різне метальна зброя ви знищите противника і отримаєте за це окуляри.
