До сих пір Маріо доводилося мати справу тільки зі злими грибочками, равликами і іншими поплічниками його вічного ворога Боузер. Але це лише квіточки, порівняно з тим, що чекало на нього в Super Mario Commander. На Мир Маріо несподівано було скоєно підступне напад з космосу. Страшні і злісні істоти, озброєні до зубів влаштували хаос в колись мирному королівстві. Доведеться Маріо взяти в руки серйозна зброя і виступити в ролі супер героя. А щоб у нього все вийшло, допоможіть водопровідникові освоїти нову для себе роль. Необхідно очистити платформи від космічних піратів і знову повернути світ на землі в Super Mario Commander.