У війну насамперед ворог намагається знищити військові об'єкти: аеродроми, військові частини, склади боєприпасів. У грі Atomic Fighter 2D ви сядете за штурвал винищувача, щоб захистити небо над військовою базою. До неї вже наближається ескадра ворожих штурмовиків та бомбардувальників. Ваше завдання – утримати оборону та активно атакувати супротивника по всьому фронту. Переміщуйте винищувач ліворуч або праворуч, йдучи від обстрілів назустріч ворожих літаків, що летять, і самі атакуйте і обстрілюйте, знищуючи один за одним літаки. Збирайте нальоту різні бонуси, вони допоможуть впоратися з величезною кількістю ворогів, що наступають, в Atomic Fighter 2D.