Над головним героєм гри Mutant Escape у секретній лабораторії проводили досліди. Вчені виводили з нього мутанта для військових потреб. Одного разу їх охоронців забув зачинити двері в камеру і наш герой зміг вибратися на волю. Тепер він зможе втекти і ви допоможете йому в цьому. За допомогою клавіш управління ви вказуватимете в який бік ваш персонаж повинен буде рухатися. Дорогою він повинен буде збирати різні предмети та зброю. Лабораторією ходить охорона з якою вашому персонажу потрібно буде вступити в бій. Влучно стріляючи ви знищуватимете своїх противників і за це вам у грі Mutant Escape будуть давати очки. Також ви зможете підбирати трофеї, які можуть випасти з охоронців.