У грі Ben 10: Brains vs Bugs ви повинні допомагати кумедному зеленому прибульцю звільняти своїх викрадених друзів. Перед вами на екрані буде видно ваш персонаж, який перебуватиме у певній локації. За допомогою клавіш керування ви керуватимете його дії. Ваш герой повинен буде пройтися певним маршрутом долаючи різні пастки та інші небезпеки. Дорогою він буде збирати золоті монети та інші корисними предмети, які будуть приносити вам у грі Ben 10: Brains vs Bugs окуляри і можуть наділити персонажа різного роду бонусами. Також ваш персонаж повинен буде битися з жуками, які траплятимуться на його шляху.