Люди хворіють і від цього нікуди не дітись, тому фармакологи працюють, не покладаючи рук, а лікарі напихають пацієнтів таблетками. У грі Pill Puzzler ви також долучитесь до цього безперервного процесу і для початку вам потрібно заготовити таблетки, щоб було що годувати пацієнтам. Заходьте в лабораторію і на таці з'являться різнокольорові пігулки. Ви повинні за мінімальну кількість ходів розподілити їх по коробках, а потім вирушайте до лікарні приймати хворих. Кожному видайте те, що їм наказано і якнайшвидше, вони не хочуть чекати. На виручені гроші ви зможете обладнати кабінет лікаря у Pill Puzzler.